Фамилия Нейсин — один из тех случаев, когда написание обманчиво: на слух она звучит как типичная русская фамилия с суффиксом -ин, но корень у неё не славянский, а еврейский. В отличие от фамилий вроде «Носов» или «Сысин», где основа — русское прозвище или имя, здесь мы имеем дело с патронимом, образованным от личного имени Не́йса (Nejse) — варианта библейского имени Ни́сан (Nisan). Это имя, в свою очередь, связано с названием весеннего месяца нисан по еврейскому календарю, на который приходится Песах. Таким образом, Нейсин буквально означает «сын (или потомок) Нейсы».

Словообразовательная модель проста: к основе Нейс- добавлен типичный русский патронимический суффикс -ин, который в XIX — начале XX века массово «пришивали» к еврейским фамилиям при записи в метрических книгах и паспортах на территории Российской империи. Именно этот суффикс, а не окончание, делает фамилию внешне похожей на русские, хотя по происхождению она относится к группе ашкеназских фамилий, возникших в черте оседлости.

Географически фамилия Нейсин чаще всего встречается среди еврейского населения бывших западных губерний — Волынской, Подольской, Киевской, а также в Беларуси. Встречается она и в современной России, но почти всегда у носителей, чьи предки жили в тех регионах. Интересная деталь: в некоторых документах XIX века фамилию могли записывать как Нейсинъ (с твёрдым знаком на конце) или путать с похожей фамилией Нейс (без суффикса), что говорит о неустойчивости орфографии при первичной фиксации.

В словарях еврейских фамилий (например, в работах А. Бейдера или Л. Зайдмана) Нейсин обычно связывают именно с именем Нисан, а не с каким-либо ремеслом или прозвищем. Версия о происхождении от слова «нейс» (нем. Neis — «новый» или идишское «нос») маловероятна и не подтверждается типовыми моделями фамилий черты оседлости. Так что предки современных Нейсиных, скорее всего, были простыми людьми — ремесленниками или торговцами, а их фамилия просто указывала на имя отца или деда, родившегося в месяц нисан.