Фамилия Нигатова — женская форма фамилии Нигатов, и её происхождение не так очевидно, как может показаться. В русской ономастике фамилии на -ов/-ев и -ин обычно образуются от имени или прозвища отца. Основа «Нигат» здесь — ключ к разгадке.

Скорее всего, Нигатов — это вариант фамилии, восходящей к тюркскому корню. В тюркских языках слово «нигат» (или близкое к нему по звучанию) может означать «редкий», «драгоценный» или даже быть личным именем с таким значением. Встречается также форма «Нигмат» (от арабского «нигмат» — «благо», «благодать»), которая через диалектное произношение могла перейти в «Нигат». Таким образом, предок носителя фамилии мог получить прозвище Нигат как человек ценный, редкий или благословенный.

Менее вероятна, но возможна связь с русским диалектным словом «нигать» или «нига» — в некоторых говорах так называли нерадивого, ленивого человека. Однако, учитывая, что фамилия встречается преимущественно в Поволжье и на Южном Урале, где сильно татарское и башкирское влияние, тюркская версия выглядит убедительнее.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия формировалась в русской среде или была русифицирована. Фамилия Нигатова не относится к числу дворянских или старых московских — её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами из регионов смешанного населения.

География фамилии сегодня неширокая: основные следы ведут в Татарстан, Башкортостан и Оренбургскую область. Встречается она и у казахов, что подтверждает её тюркские корни.