Фамилия Ниханошин — редкий пример того, как личное имя превратилось в фамилию, сохранив при этом необычный суффикс. В её основе лежит крестильное имя Никанор, которое в просторечии звучало как Никаноша или Ниханоша — с характерной для народной речи заменой «к» на «х» (сравните: Акилина — Охрима, Кир — Хир). Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ниханошин буквально означает «сын Ниханоши» или «человек из семьи Ниханоши». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -а или -я.

Обратите внимание на суффикс -ош-/-ох-: в русской антропонимии он часто служил для образования уменьшительно-ласкательных форм имён (Тимоша, Яроша, Никаноша). Так что Ниханоша — это не просто сокращение, а ласковое, домашнее обращение к человеку по имени Никанор. Само имя Никанор греческого происхождения, от слов «нике» (победа) и «анир» (мужчина), то есть «победоносный муж». В святцах оно встречается, но никогда не было массовым, поэтому и фамилия Ниханошин остаётся довольно редкой.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям — там, где аканье и замена «к» на «х» в просторечии были особенно сильны. Встречается она и среди старообрядцев, которые нередко сохраняли архаичные формы имён. Никаких известных дворянских родов с такой фамилией нет — скорее всего, предки Ниханошиных были крестьянами или мещанами, а сама фамилия закрепилась за одной ветвью в конкретной местности.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Никаноров и Никаношин встречаются чаще, а вот Ниханошин — более редкий вариант с той самой народной фонетической переделкой. Это делает фамилию ценной для историков языка: она — живое свидетельство того, как в XVIII–XIX веках звучала русская речь в деревне.