Фамилия Никлашков — редкий пример того, как просторечная форма крестильного имени закрепилась в фамильном прозвище. В её основе лежит имя Никлаш, которое возникло в русской народной среде как обиходный вариант канонического имени Николай. Уменьшительно-ласкательные формы на -аш (Никлаш, Миклаш, Микулаш) были распространены в северных и центральных губерниях России, где имя Николай, одно из самых частых, дробилось на десятки местных вариаций.

Суффикс -ов в фамилии Никлашков — стандартный патронимический показатель, указывающий на принадлежность: «сын Никлаша». Однако здесь есть особенность. В отличие от фамилий типа Никлашин, образованных с помощью суффикса -ин (от основ на -а), форма Никлашков использует суффикс -ов, что обычно свойственно основам на твёрдый согласный. Такое смешение моделей встречается в фамилиях, которые закрепились не сразу, а прошли через этап прозвища или двойного оформления. Возможно, первоначально бытовало прозвище Никлашко — так в старину называли не только детей, но и взрослых людей в бытовом общении. От него и пошла фамилия Никлашков, где -к- перед суффиксом — остаток того самого прозвищного суффикса -ко.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России. Встречается в Псковской и Новгородской областях, а также в Вологодчине. Именно там имя Николай в народной речи чаще всего редуцировалось до Никлаш, Миклаш, а не до привычного Коля или Николаша. В этих краях фамилия могла закрепиться за крестьянами или посадскими людьми — в среде, где имя собственное часто заменялось уличным прозвищем, а потом переходило к детям как официальная фамилия.

Родственных фамилий с той же основой немного: Никлашин, Никлашев, а также украинские и белорусские варианты Миклашевич, Миклашов. Но Никлашков стоит особняком — двойной суффикс (-к- + -ов) выдаёт в ней не просто отчество, а прозвище, которое успело обрасти дополнительным окончанием. Это делает фамилию более поздней по времени закрепления, чем, скажем, Никлашев, и более редкой: в современных справочниках она встречается единично, в основном на территории бывшей Псковской губернии.