Фамилия Никошина — женская форма, но в русской традиции её разбирают по мужской основе: Никошин. В центре внимания здесь суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Никошин, то есть сын или потомок Никоши. Сама основа Никоша — это разговорная, уменьшительная форма от крестильного имени Николай. В народной среде имя Николай, греческое по происхождению (от «нике» — победа), давало множество производных: Никола, Никула, Микола, а также Никоша, Никуша, Ника. Таким образом, фамилия Никошин (и Никошина) — типичный пример «полуотчества»: не полное церковное имя, а его домашний, обиходный вариант закрепился в качестве родового прозвания.

Интересно, что фамилия эта довольно редкая и имеет чёткую географическую привязку. По данным современных исследований, основная масса носителей фамилии Никошины сосредоточена в центральных и северных областях России — в Костромской, Вологодской, Кировской областях, а также в Пермском крае. Это не случайно: именно на Русском Севере и в Поволжье особенно любили «домашние» формы имён, и там фамилии на -ин от уменьшительных имён встречаются чаще, чем, скажем, в южнорусских регионах. Предок современных Никошиных, скорее всего, был крестьянином или посадским человеком, которого в быту звали Никоша, а его дети пошли по отцу — Никошины.

Словообразовательная модель проста, но показательна: суффикс -ин присоединяется к основе, оканчивающейся на -а (Никош-а), что характерно для прозвищ и уменьшительных имён. В отличие от фамилий на -ов/-ев (от основ на твёрдый согласный), фамилии на -ин часто происходят именно от «коротких» имён, и Никошин — один из таких примеров. Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Никулин (от Никула) или Никольский (от места, связанного с храмом Николая) встречаются гораздо чаще, а Никошин остаётся локальным, «камерным» вариантом, что делает её ценной для тех, кто ищет свои корни в конкретной местности.

Споров о происхождении практически нет: версия от имени Николай через форму Никоша — единственная убедительная. Иногда можно встретить попытку связать фамилию с диалектным словом «никоша» (так в некоторых говорах называли неловкого или тихого человека), но это слабая гипотеза: во-первых, такого слова нет в авторитетных словарях, во-вторых, модель образования фамилий от полных форм имён (с усечением) гораздо типичнее. Поэтому для человека, носящего фамилию Никошина, самый прямой ответ: ваши предки — потомки человека по имени Николай, которого в кругу семьи или деревни звали ласково Никоша.