Фамилия Никуйко образована от прозвища Никуй, в основе которого, вероятно, лежит слово «никуй», в переводе с иврита означает «уборка помещения». Можно предположить, что так прозвали чистоплотного человека, который часто убирался дома или того, кто зарабатывал уборкой помещений. По другой версии, прозвище Никуй восходит к тюркскому слову «ник» - «почему, зачем, отчего». В этом случае не исключено, что данное прозвище получил любознательный ребенок. Согласно еще одной гипотезе, фамилия Никуй является уменьшительной формой мужского имени Никанор (в переводе с греческого означает «увидевший победу») или Никандр (от греческого nikao - «победа» и Andros - «мужчина»). Характерный суффикс -ко указывает на то, что фамилия Никуйко возникла под украинским влиянием. Например, только у евреев можно было встретить такие фамилии, как Вейценбаум, что в переводе с немецкого означало «пшеничное дерево», Зауэрштром – «кислый поток», Левенфиш – «рыба-лев», Цигенбаум – «козье дерево», Квечман – «высказываться неохотно».