Фамилия Нильск, скорее всего, происходит от сокращенной формы мужских имен Корнилий (от латинского «рог») и Саторнил (от имени римского бога Сатурн). Эти имена употреблялись в форме Нил или Нила. Не исключено, что данная фамилия связана с употреблявшимся в архангельских краях словом «нилас». Так называли тонкий осенний лед, который скапливался в море и устьях рек. Поэтому прозвище Нильск мог носить человек неспокойный, неуравновешенный. Возможно, что эту фамилию получил житель Новой Земли, поселившийся на длинной косе, которая называлась «нилакса». Существует еще одна версия происхождения фамилии. Известно, что на территории Польши протекает река с похожим названием – Ниль. Она является небольшим притоком реки Пжирва и берет свое начало в селе Заполе. Можно предположить, что предок обладателя данной фамилии проживал в одном из польских поселений на берегах Нили. Эта версия и представляется наиболее правдоподобной.