Фамилия Нильский относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от имени Нил. Имя Нил представляет собой краткую форму канонического имени Неонил (в переводе с греческого «молодой, новый»), Саторнил (от латинского «тот, кому покровительствует Сатурн — божество посевов») или же является самостоятельным крестильным именем, которое предположительно образовано от названия африканской реки Нил. Суффикс -ский в этом случае указывает на украинское происхождение фамилии Нильский. Согласно другой версии, фамилия Нильский образовано от прозвища Нильский, которое получил выходец с берегов реки Ниль, протекающей в Польше. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Нильских можно лишь на основании глубоких и серьезных генеалогических исследований.