Фамилия Нисапов — редкий случай, где основа, скорее всего, не русская, а тюркская, но оформлена типично русским патронимическим суффиксом -ов. Если отбросить окончание, получим корень «Нисап». Самое прямое объяснение лежит в татарском, башкирском или казахском языке, где «Нисап» (иногда «Нысап») означает «совесть», «честь», «порядочность». В этом случае фамилия происходит от прозвища или мусульманского имени-пожелания Нисап, которое давали ребенку, желая ему вырасти честным и совестливым человеком. Модель образования проста: имя Нисап + русский суффикс принадлежности -ов, что буквально значит «сын Нисапа».

Есть и менее очевидная, но возможная версия. В некоторых тюркских диалектах «нисап» (от арабского «нисаб») — это «происхождение», «родословная», а также «количество», «норма». Прозвище Нисап могли дать человеку, который хорошо знал свою родню и мог перечислить предков, или, наоборот, тому, кто строго соблюдал меру в делах. Но версия с «совестью» встречается в ономастических справочниках по тюркским фамилиям чаще.

Географически фамилия Нисапов тяготеет к регионам Поволжья и Урала — Татарстану, Башкортостану, Оренбургской области. Встречается и у казахов, но там чаще пишется как Нисапбаев или Нысапов. Русская орфография закрепила написание через «и», хотя в оригинале звук может быть ближе к «ы». Интересно, что в дореволюционных метрических книгах эту фамилию могли записать как Несапов — под влиянием акающего произношения.

В отличие от многих фамилий на -ов, Нисапов не имеет отношения к профессиям или животным. Это «именная» фамилия, образованная от личного имени или прозвища, что роднит её, например, с фамилиями Абсалямов, Насыров или Сагитов. Сословного барьера у неё не было: Нисаповы могли быть и крестьянами, и купцами, и муллами — всё зависело от конкретного рода.