Фамилия Нискоблин — редкая и по звучанию, и по происхождению. Её основа не связана напрямую с каким-либо ремеслом или именем, а восходит к прозвищу, которое отражало характер или поведение человека.

В центре фамилии — глагол «скоблить» (скрести, чистить). С помощью приставки «нис-» (церковнославянский вариант приставки «низ-», означающей движение вниз или действие, направленное вниз) образовалось слово «нискоблить». В диалектах и просторечии «нискоблить» могло означать «соскоблить, счистить всё дочиста», а в переносном смысле — «обобрать, ободрать». Соответственно, прозвище Нискобля (или Нискоблин) могли дать человеку прижимистому, дотошному, скуповатому, который «всё подчистую выскребает». В ономастике такие прозвища по чертам характера — обычное дело, и фамилия закрепилась именно в этой модели.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Нискоблин, то есть сын или потомок Нискобли. Это типичная русская патронимическая модель, уходящая корнями в XVI–XVII века, когда прозвища становились наследственными фамилиями. Важно, что приставка «нис-» в фамилиях встречается редко (сравните с фамилией Нисковских), что делает Нискоблина лингвистически примечательным случаем.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и западнорусским говорам, где приставка «нис-» была более употребительна, чем в северных диалектах. Вероятный ареал бытования — Брянская, Курская, Орловская области или прилегающие территории, где в прошлом активно использовались формы с «нис-» и «ис-» вместо «из-» и «низ-». Сословно предки Нискоблиных, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — именно в этих средах прозвища по поведению закреплялись легко, а фамилии на «-ин» были распространены повсеместно.

Встречается и более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть от названия деревни или урочища Нискобли (например, от «низкий скобель» — инструмент, которым скоблят), но документальных подтверждений такому топониму нет. Поэтому версия с прозвищем остаётся основной: Нискоблин — потомок человека, которого в округе звали «Скобля» или «Нискобля» за его манеру «всё до нитки выскребать».