Фамилия Нискина — одна из тех, где форма на -ин наводит на мысль о происхождении от личного имени или прозвища, но не всё так очевидно. По модели образования это типичная «материнская» или «женина» фамилия: суффикс -ин указывает на принадлежность, а основа Ниск- могла быть женским именем или прозвищем. Чаще всего такие фамилии давали по матери (если отец был неизвестен или умер рано) или по жене (вдовец, живший у тёщи). В основе лежит либо уменьшительная форма имени Ника (от греческого «победа»), либо редкое каноническое имя Нискин, которое встречается в святцах как вариант имени Никита. Но есть и более прозаичная версия: в некоторых говорах «ниска» — это низкое место, низина, лощина. Тогда прозвище Ниска мог получить человек, живший в низине, или, в переносном смысле, невысокий ростом.

География фамилии подсказывает, что она не была массовой. Наибольшая концентрация носителей — в Поволжье и на Урале, что характерно для фамилий, возникших в среде старообрядцев или крестьян, переселявшихся в XVII–XVIII веках. Встречается также форма Нискин (мужской вариант), а Нискина — женская по происхождению, но в современном русском языке она закрепилась как неизменяемая фамилия для женщин. Стоит отметить, что в дореволюционных метрических книгах эта фамилия часто записывалась через «о» — Носкина, что может путать исследователя: в некоторых диалектах «носка» означала «носок» (обуви) или «ноша», и тогда корень совсем другой. Однако вариант с «и» устойчивее и, скорее всего, первичен.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» эта фамилия не выделена отдельно, но по модели она вписывается в группу фамилий от женских имён, которые он подробно разбирает. Если ваш предок носил фамилию Нискин, то с большой вероятностью он был либо сыном женщины по имени Ниска (Ника), либо жил в местности с названием Нискино — такие деревни есть в бывшей Вятской губернии. Социальный состав носителей — в основном крестьяне и мещане, дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано. Так что за фамилией стоит не громкая история, а бытовая: имя, прозвище или место, где стояла изба.