Фамилия Нискоклон — редкий пример сложения двух основ, где вторая часть, «клон», явно связана с поклоном, то есть наклоном головы или тела. Первая часть, «ниско», в древнерусском и диалектах означала «низко». Получается, что Нискоклон — это «низко кланяющийся». Словообразовательная модель здесь прозрачна, но необычна: фамилии, образованные от глагольных сочетаний («ниско кланяться»), в русской традиции встречаются реже, чем от прозвищ по ремеслу или внешности. Скорее всего, прозвище Нискоклон дали человеку с подчеркнуто почтительной манерой поведения, возможно, в церковной или крестьянской среде, где земные поклоны были частью быта.

Суффикс отсутствует — фамилия застыла в форме чистого прозвища, без типичных родовых окончаний -ов, -ев или -ин. Такое оформление встречается у фамилий украинского, белорусского или южнорусского происхождения, где прозвища нередко переходили в фамилии без изменений. В официальных документах XIX века подобные «голые» фамилии могли фиксироваться у крестьян или однодворцев. Если бы фамилия писалась как Нискоклонов, она бы указывала на потомка человека с таким прозвищем, но форма Нискоклон предполагает, что прозвище стало фамилией напрямую, что говорит о её относительно позднем закреплении.

В ономастических справочниках фамилия не упоминается, что подтверждает её редкость. Однокоренные варианты — Нисколов, Нискошный — тоже малочисленны. Есть соблазн связать «клон» с греческим «клон» (ветвь) или латинским корнем, но для русской фамилии это маловероятно: все аналоги в русском быту (поклон, наклон, откланяться) указывают на жест. Вероятно, носители фамилии сосредоточены в нескольких регионах Центральной России или Поволжья, где сохранялись старые прозвищные формы. Точных данных о сословной принадлежности нет, но по модели образования можно предположить крестьянское или мещанское происхождение без дворянских корней.