Фамилия Ниссов восходит к топониму Ниса — город близ Ашхабада в Туркмении. этот город являлся резиденцией царя Парфии. Ныне на его месте расположены городища Старая Ниса и Новая Ниса. До настоящего времени сохранились остатки укреплений, городских кварталов, храмов, дворцов, архив хозяйственных документов, произведений искусства и др. Согласно другой гипотезе, фамилия Ниссов имеет искусственное происхождение и образована от имени Нис - персонаж древнегреческой мифологии, сын Пандиона II и Пилии, правил в Мегарах, основал Нисею. Посередине головы Ниса был пурпурный волос, с которым была связана его жизнь. Его дочь Скилла влюбилась в Миноса, осаждавшего Мегары, и вырвала волос, после чего Нис превратился в желтокрылого орла. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Нисс, со временем получил фамилию Ниссов.