Фамилия Нитта — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с итальянским оригиналом, но носители её в подавляющем большинстве русские. В Италии Нитта (Nitta) — географическая фамилия, восходящая к названиям нескольких коммун в Ломбардии и Эмилии-Романье. Однако в русском контексте объяснение лежит в другой плоскости.

Скорее всего, перед нами не итальянский след, а результат адаптации иностранной фамилии или прозвища в среде русских немцев, поляков или прибалтийских народов. В немецком языке Nitte — диалектное слово, означающее «комар» или «мошкара». Прозвище могли дать надоедливому человеку или, наоборот, тому, кто жил в болотистой местности. В польском и белорусском языках есть глагол «нітаць» (ныть, жаловаться) — отсюда могло возникнуть прозвище Нитта для ворчуна или плаксивого ребёнка.

Морфология фамилии необычна для русского уха: окончание -а не склоняется по мужскому роду в бытовой речи, что типично для фамилий польского или украинского происхождения (сравните: Нитта — он, Нитта — она). В дореволюционных метрических книгах можно встретить написание «Нитто» — так фамилию могли «обрусить», прибавив типичное окончание -о, как в фамилиях Данило, Дорофеево.

Единичные упоминания фамилии встречаются в документах Санкт-Петербургской губернии начала XX века — вероятно, это потомки мастеровых, приглашённых из Прибалтики. Окончательного ответа о происхождении нет, но две рабочие версии — немецкая «комариная» и польско-белорусская «нытиковая» — покрывают почти все случаи бытования этой фамилии на востоке Европы.