Фамилия Ноевы образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. В её основе лежит мужское личное имя, а суффикс -ев указывает на принадлежность: «Ноев» значит «сын Ноя», «ребёнок Ноя». Это типичная притяжательная модель, которая в XV–XVII веках закреплялась за потомками человека с таким именем.

Наиболее очевидная версия происхождения — связь с библейским именем Ной (на иврите Ноах, по-арабски Нух). В переводе с древнееврейского оно означает «успокаивающий, умиротворяющий». Родители могли назвать сына в честь десятого и последнего из допотопных ветхозаветных патриархов, родоначальника послепотопного человечества. Имя было известно на Руси через церковные календари, хотя широкого распространения не получило — отсюда и редкость фамилии.

Однако существует и другая, не менее правдоподобная гипотеза. Согласно ей, внутрисемейное имя Ной связано с русским глаголом «ныть» — «болеть, ломить», «плакать, капризничать». Скорее всего, оно имело особый, тайный смысл и использовалось как «охранительное» имя-оберег. Подобные «негативные» имена присваивались детям, чтобы отвратить злые силы: не искушая судьбу, родители давали имя со значением, прямо противоположным желаемому. Надеясь вырастить здорового и послушного мальчика, они называли его Ноем — как бы «нытиком», чтобы беды и хвори обошли его стороной. Эта практика хорошо известна в русской крестьянской среде: имена вроде Некрас, Неждан, Немил строились по той же логике.

Не исключено, но маловероятно, что фамилия имеет шорские корни и связана со словом «ной», которое переводится как «уставать, ослабевать». Предположительно, и в этом случае она могла произойти от охранительного имени: имена-обереги, защищающие от нечистой силы, присутствуют у многих народов. Нарекая малыша Ноем, родители желали ему вырасти здоровым и сильным мужчиной — то есть, по логике оберега, называли его противоположным качеством.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на столетия, а редкие библейские имена часто давали лишь в отдельных семьях, что затрудняет географическую привязку. Любопытно, что однокоренных фамилий — Ной, Нойкин, Нойков — в русской среде практически нет, что делает Ноевых довольно уникальным случаем. В отличие от массовых фамилий на -ов, образованных от календарных имён вроде Иванов или Петров, эта завязана на имя, которое почти не использовалось в быту, и потому её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких немногочисленных родов, где имя Ной передавалось по традиции.