Фамилия Новокрещин — редкий пример того, как русская фамилия напрямую фиксирует важнейшее событие в жизни человека: смену веры. Её основа — «новокрещ(е)н», то есть человек, недавно принявший крещение. В Московской Руси так называли крещёных татар, башкир, мордву, чувашей и представителей других народов, переходивших из ислама или язычества в православие. Фамилия образована по типичной притяжательной модели: суффикс -ин указывает на принадлежность к роду, «чей?» — Новокрещин, то есть сын или потомок новокрещена.

Интересна орфографическая деталь: в фамилии пишется «щ», а не «ш». Это не ошибка, а архаичное написание, которое отражает древнерусское произношение сочетания «ск» перед «е» (как в слове «крещен» от «крест»). В XIX веке написание через «щ» было нормой для церковной и деловой лексики, поэтому фамилия сохранила эту форму, в отличие от более поздних вариантов «Новокрешев» или «Новокрестов».

С географической точки зрения фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — регионам, где в XVI–XVII веках активно шла христианизация нерусских народов. Предки Новокрещиных могли быть либо выходцами из крещёных татарских мурз, либо крестьянами-новокрещенами из мордовских или чувашских селений. В отличие от фамилий, образованных от прозвищ или профессий, эта не даёт намёка на характер или занятие, но зато чётко указывает на этническую и конфессиональную границу, которую переступил родоначальник.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Крещёнов, Крестинин, Новокрестов) показывает, что Новокрещин — самая точная в словообразовательном смысле: она буквально повторяет термин «новокрещен», который использовался в официальных документах (писцовых книгах, синодиках). Другие варианты часто возникали при переписи населения из-за упрощения на слух или замены редкого «щ» на более привычное «ш», но исходная форма сохранилась именно в этом написании.