Фамилия Ножуева образована от мужского имени или прозвища Ножуй. Сразу отметим: это не очевидная связь с ножом, хотя внешнее сходство и провоцирует на такую догадку. На самом деле в основе лежит древнерусское нецерковное имя Ножуй, которое фиксируется в исторических документах. Имя было образовано от глагола «ножити» — в древнерусском языке это означало «жить, пребывать, обитать». Соответственно, Ножуй — это «живущий», «обитатель». Фамилии, образованные от таких «жизненных» прозвищ, не редкость: вспомните Живулёв, Живулин, Живов.

Суффикс -ев в фамилии указывает на принадлежность: Ножуев — сын Ножуя. По модели это типичная русская патронимическая фамилия, распространённая в северных и центральных регионах России. Важно не путать её с фамилией Ножев, которая действительно происходит от слова «нож» и могла принадлежать оружейнику или человеку с острым характером. У Ножуевой история другая — более мирная, связанная с бытовым именем-пожеланием.

Встречаемость фамилии сегодня невысокая, что говорит о её локальном происхождении. Скорее всего, предки носителей фамилии были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию в XVII–XVIII веках, когда шёл массовый процесс закрепления родовых имён. Географически фамилия тяготеет к Вологодской, Архангельской областям и Поволжью — именно там сохранились архаичные именные формы. Если искать однокоренные фамилии, то стоит обратить внимание на Ножуевых, Ножуйкиных и Ножуйских — все они восходят к тому же корню «ножи-».