Фамилия Нягматуллина — женская форма фамилии Нягматуллин, которая образована от арабского имени Нигматулла (варианты: Нигматулла, Нягматулла). Основа здесь — арабские слова «нигмат» (благодать, милость) и «Аллах» (Бог). В буквальном переводе имя означает «милость Аллаха» или «божья благодать». Это типичная для тюркских народов мусульманская модель: к арабскому теофорному имени (содержащему отсылку к Богу) добавляется русский патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность роду. То есть Нягматуллин — «сын Нягматуллы», а Нягматуллина — «дочь» или «жена» из этого рода.

Географически фамилия чаще всего встречается у татар и башкир, особенно в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. Вариант с «я» вместо «и» (Нягматуллин, а не Нигматуллин) — результат адаптации арабского звучания через тюркские языки, где «я» передаёт мягкость. Это не ошибка, а устойчивая диалектная черта.

Отдельно стоит сказать, что в советское время фамилию могли записать в документах с разной орфографией: через «я» или через «и». Поэтому у носителей одной семьи иногда встречаются разные написания — Нягматуллин и Нигматуллин. Оба считаются корректными, хотя форма с «и» ближе к арабскому оригиналу, а с «я» — к живому произношению в татарском языке.

Сословный состав носителей фамилии типичен для мусульманского населения Поволжья и Приуралья: среди предков были и крестьяне, и торговцы, и муллы. Фамилия не указывает на конкретное ремесло или прозвище — её корень чисто именной, религиозно-благодатный.