Фамилия Няккоев — редкая, и её разбор требует внимания к деталям словообразования. В основе лежит имя или прозвище Някко, которое, скорее всего, имеет финно-угорское происхождение. Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий (чей? — сын Някко), но сама основа явно не славянская и не тюркская, что сразу выделяет её среди более привычных фамилий на -ов.

Някко — это, вероятно, адаптированная форма карельского или вепсского имени. В этих языках корень «някк-» может быть связан со значением «слабый», «хилый» или, напротив, «упрямый», «крепкий» (в зависимости от диалекта). В ономастике известны карельские фамилии с похожим звучанием, например, Няккинен или Няккяляйнен, где -нен — типичный финно-угорский суффикс принадлежности. Носители фамилии Няккоев, скорее всего, происходят из районов расселения прибалтийско-финских народов — Карелии, Ленинградской или Вологодской областей, где русские фамилии нередко образовывались от местных имён.

Интересно, что суффикс -ев, а не -ин, тоже говорит о многом. Если бы основа оканчивалась на -а или -я, мы бы получили Няккин, но здесь — Няккоев. Это может указывать на то, что исходное прозвище Някко воспринималось как слово мужского рода с окончанием на -о, что характерно для многих финно-угорских заимствований в русских говорах (сравните с фамилией Пеккоев от имени Пекка). Таким образом, предок Няккоевых мог быть карелом или вепсом, который получил прозвище за какую-то черту характера или внешности, а его дети уже обрусели и оформили фамилию по русскому образцу.

Других версий, например тюркских, для этой фамилии практически нет — звуковой облик «няк» нехарактерен для тюркских языков, где преобладают корни с «й» или «н’». Спорным остаётся лишь точное значение прозвища: могло ли оно быть уничижительным (вроде «хиляк») или, наоборот, ласкательным (уменьшительное от имени). Но в любом случае, Няккоев — это яркий след северного, финно-угорского субстрата в русской фамильной системе, сохранившийся в очень узком кругу семей.