Фамилия Ныгманова — женская форма фамилии Ныгманов, а та, в свою очередь, происходит от мужского имени Ныгман. Это имя восходит к арабскому «Нигмат» (Ni‘mat), что означает «благо», «милость», «благодать». В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя трансформировалось в форму Ныгман (или Нигман) через характерное оглушение и редукцию гласных. Таким образом, основа фамилии — не прозвище и не ремесло, а личное имя с религиозным подтекстом, популярное в мусульманских семьях Поволжья и Приуралья.

Модель образования типична для русской и тюрко-русской ономастики: суффикс -ов (в женском роде -а) присоединяется к основе имени. В отличие от чисто русских фамилий на -ин, здесь нет указания на принадлежность отцу через притяжательное значение («чей сын?»). Скорее, это фиксация родового прозвища по имени основателя рода: Ныгмановы — потомки некоего Ныгмана. Суффикс -ов в тюркских фамилиях часто выступает как русифицирующий элемент, который добавляли при переписях и паспортизации в XIX–XX веках.

Географически фамилия Ныгманова (и Ныгманов) наиболее плотно представлена в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской области и в среде казанских татар, живущих в диаспоре. Встречается она и у казахов, но там более распространена форма Ныгманов или Ныгман, без русского суффикса, что указывает на иной путь адаптации — через прямое наследование имени как фамилии.

Из-за редкости корня спорных версий почти нет. Альтернативное толкование — связь с арабским «Нагим» (райское наслаждение) — маловероятно, так как форма Ныгман устойчиво фиксируется именно как вариант имени Нигматулла (Нигмат + Аллах). Фамилия не имеет отношения к сословным группам: её могли носить и крестьяне, и купцы, и духовенство, поскольку имя было распространено во всех слоях татарского общества. Единственная деталь, которая выделяет её среди десятков похожих фамилий, — сохранение твёрдого «ы» вместо мягкого «и», что выдает диалектное произношение, типичное для мишарского говора татарского языка.