Фамилия Ныколын — одна из тех, что с первого взгляда кажется простой, но при детальном разборе ставит перед исследователем несколько загадок. Начнём с самого очевидного: суффикс -ын указывает на принадлежность, отчество. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Следовательно, в основе фамилии лежит личное имя Ныкола или Ныколя.

Здесь и возникает первый вопрос. Самое распространённое объяснение — это диалектная или фонетическая форма канонического имени Николай. В северных и сибирских говорах, а также в украинском и белорусском языках, имя Николай нередко произносилось как «Ныколай», а его уменьшительная форма — «Ныкола». Переход «о» в «ы» в безударном положении — явление, хорошо известное исторической фонетике. Таким образом, Ныколын — это буквально «сын Ныколы», то есть потомок человека по имени Ныкола (Николай). Версия правдоподобная и самая простая.

Однако есть и альтернативная гипотеза, хотя и менее вероятная. В южнорусских и украинских говорах слово «ныколить» могло означать «приставать, надоедать», а «ныкола» — ворчливый, докучливый человек. В этом случае фамилия образовалась бы не от крестильного имени, а от прозвища, характеризующего поведение предка. Но, учитывая широкую распространённость имени Николай и его вариантов, версия с прозвищем выглядит натянутой: для неё нет устойчивой лексической базы в словарях, а вот имя Ныкола встречается в исторических документах.

Что касается географии, фамилия Ныколын — редкая. Её очаги, скорее всего, находятся в регионах, где было сильно влияние северных или юго-западных говоров: в Архангельской, Вологодской областях, а также на Украине или в Белоруссии. Суффикс -ын, а не -ов, дополнительно указывает на то, что основа имени оканчивалась на -а (Ныкола). Сравните с однокоренными фамилиями: Никулин (от Никула) или Николенко (украинская модель). Ныколын стоит в этом ряду особняком именно из-за начального «ы», которое и делает её такой узнаваемой и необычной для современного уха.