Фамилия Нысангожина образована от имени Нысангожа, которое состоит из двух компонентов, каждый из которых представляет собой отдельное имя. Имя Нысан восходит к тюркскому слову nisan - «знак, отметина, печать», а также «цель». Гожа — это вариант персидского имени Ходжа, что в переводе означает «хозяин, владелец, господин», «обладающий большими знаниями, наставник, учитель». Таким образом, имя Нысангожа можно перевести как «учитель, хозяин, отмеченный знаком». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Нысангожиных можно лишь на основании генеалогических исследований.