Фамилия Онтобоев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Онтобоев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Онтобоев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Онтобоев образована от прозвища Онтобой. Оно ведет свое начало от двух киргизских слов: «онто» - «стонать, покряхтывать» и «бой» - «миниатюрный, изящный». Вероятно, прозвище содержало указание как на черты характера (склонный к жалобам, плаксивый, чувствительный, эмоциональный), так и на особенности внешности основателя фамилии (грациозный, красивый). Согласно другой гипотезе, фамилия Онтобоев восходит к топониму Онтоба — муниципалитет в Испании, входит в провинцию Гвадалахара, в составе автономного сообщества Кастилия — Ла-Манча. Не исключено, что предок Онтобоевых родился или долгое время жил в этом населенном пункте. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Онтобоев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Онтобоев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.