Фамилия Особенко имеет украинское происхождение и относится к распространенному типу фамилий, образованных от прозвищ. В её основе лежит прозвище Особа, которое в старину было не редкостью, а позже закрепилось как наследственное имя.

Слово «особа» в русском языке означало «человек, личность», а также «важное лицо, персона». Поэтому прозвище Особа могли дать человеку, который выделялся индивидуальностью и неповторимым характером, либо тому, кто занимал высокое социальное положение и был наделён властью. Такая версия выглядит вполне логичной: прозвища часто отражали либо внутренние качества человека, либо его место в обществе.

Существует и другая, не менее убедительная версия, связанная с украинским словом «особе», то есть «отдельно». В этом случае Особа — прозвище нелюдимого, замкнутого человека, который держался в стороне от других. Не исключено также, что так называли того, чей дом стоял на отшибе, в отдалении от соседских дворов. Эта версия хорошо согласуется с тем, что фамилия Особенко распространена именно в украинской среде, где слово «особе» звучало естественно и понятно.

Суффикс -енко в фамилии — типичный украинский патронимический формант, который изначально указывал на сына или потомка человека по прозвищу. То есть Особенко буквально означает «сын Особы». Такая модель образования фамилий была особенно популярна в Левобережной Украине и на Слобожанщине, где фамилии на -енко встречаются повсеместно.

Со временем прозвище Особа, которое сначала присоединялось к наследственному имени, полностью вытеснило его и в быту, и в официальных документах. Так и закрепилась фамилия Особенко, которая сегодня не редкость в украинских и российских родословных.