Фамилия Овакимов — редкий случай, когда русская фамилия образована не от русского имени. Её основа — армянское имя Оваким, которое является местным аналогом библейского Иоаким (в русской традиции — Яким, Аким). Имя это древнееврейское, означает «поставленный Богом» или «Бог воздвигает». Таким образом, по корню Овакимов — это та же фамилия, что и Акимов, только с иной фонетической огласовкой, характерной для армянского языка.

Модель образования здесь — типичная русская патронимическая фамилия на -ов. Суффикс -ов присоединили к основе Оваким, чтобы получить значение «сын Овакима», «потомок Овакима». Это обычный способ русификации иноязычных имён: носитель фамилии, скорее всего, был крещёным армянином или выходцем из армянской среды, жившим в русскоязычном окружении. Фамилия закрепилась в XIX веке, когда массово оформлялись родовые имена у всех сословий.

В отличие от фамилий на -янц или -ян (Овакимян, Овакимянц), которые остались бы в армянской среде, форма Овакимов указывает на ассимиляцию и переход в русскую культуру. Географически фамилия встречается там, где исторически селились армяне в Российской империи: на Северном Кавказе, в Ставрополье, в Ростовской области, в Закавказье, а также в центральных губерниях, куда переезжали семьи священников или купцов.

Интересная деталь: в церковной среде имя Оваким могло быть дано в честь святого Иоакима, отца Богородицы. Поэтому среди предков Овакимовых могли быть и священнослужители, и крестьяне, и мещане — фамилия не привязана к одному сословию. В современном русском языке фамилия может вызывать вопросы при склонении, но её родство с привычными Акимовым и Якимовым очевидно.