Фамилия Овакимьян — один из ярких примеров армянского ономастикона, который легко узнать по суффиксу -ьян (в старой орфографии -янц). Этот суффикс, восходящий к древнему показателю принадлежности или происхождения, в русской передаче часто получает дополнительную букву «ь» перед «я», что и даёт форму Овакимьян вместо более простой Овакимян. В самой Армении фамилия чаще всего пишется как Овакимян, а вариант с «ь» закрепился в среде армян, чьи предки жили на территории Российской империи — в документах XIX — начала XX века мягкий знак нередко ставили по правилам русской графики для смягчения согласного.

В основе фамилии лежит личное имя Оваким — армянская форма библейского имени Иоаким (Иоаким, в русской традиции — Яким). Имя имеет древнееврейские корни и переводится как «поставленный Богом» или «Бог воздвигает». Оно было широко распространено у армян, особенно среди священнослужителей и в крестьянской среде.

С точки зрения социального состава, фамилия Овакимьян не указывает на конкретное сословие. Она могла появиться как у духовных лиц, так и у ремесленников или земледельцев. Армянские фамилии на -ьян, как правило, закрепились в XVI–XVII веках, но окончательно оформились в XIX веке, когда Российская империя проводила переписи населения в Закавказье. Если предки носителя фамилии происходили из восточной Армении (Эриванская, Елизаветпольская губернии), то фамилия могла быть записана именно в форме Овакимьян, а если из Западной Армении (территория Османской империи), то исходное окончание чаще было -ян без мягкого знака.

В русском языке фамилия склоняется по правилам мужского рода: Овакимьян, Овакимьяна, Овакимьяну. Женский вариант не склоняется. Встречается также написание через «о» после «в» — Овакимян, но это скорее исключение, чем правило. В целом, фамилия редкая, не входит в число самых распространённых армянских фамилий, но хорошо известна в армянских общинах России, Грузии и диаспоры.