Фамилия Овакимова — женская форма от мужской Овакимов, которая образована от личного имени Оваким. Это русская адаптация библейского имени Иоаким (в церковнославянской традиции — Иоаким), которое восходит к древнееврейскому «Йехояким» — «Яхве воздвигнет» или «поставленный Богом». В русском языке имя долго бытовало в двух вариантах: книжное Иоаким и народное Оваким, Аким. Форма Оваким характерна для южнорусских и украинских говоров, где начальное «и» переходило в «о» или усиливалось протетическим согласным (ср. Иван — Ован, Илья — Олья). Таким образом, фамилия Овакимов — это «сын Овакима», то есть потомок человека по имени Оваким.

Суффикс -ов в этой фамилии — стандартный патронимический показатель, свойственный русским фамилиям, образованным от канонических или народных форм крестильных имён. Овакимовы могли принадлежать к разным сословиям: в крестьянской среде фамилию давали по имени отца, а в духовенстве она могла закрепиться за семьями, где имя Оваким передавалось из поколения в поколение. Встречаются и редкие варианты написания — Овакимов, Овакимова, а также однокоренные Акимов, Екимов, Якимов, которые образованы от тех же корней, но в разных фонетических обличьях.

Географически фамилия Овакимова редкая, но не единичная. Она фиксируется в южных регионах России, в Поволжье и в среде армянской диаспоры, где имя Оваким (арм. Հովակիմ — Оваким) также распространено. В армянском контексте фамилия может быть русифицирована через окончание -ов, хотя исконная армянская форма звучала бы как Овакимян. Поэтому у носителей фамилии Овакимова возможны две линии происхождения: русская (от имени Оваким) или армянская (от армянского варианта того же библейского имени). Точнее определить корни поможет знание региональных документов или семейных преданий.