Фамилия Падрухин — яркий пример отчества, образованного от прозвища или нецерковного имени, которое почти не встречается в современных источниках. Основа фамилии — имя Падруха. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Падрухин сын», то есть сын Падрухи.

Корень «падр-» здесь, скорее всего, не связан с глаголом «падать». В русских говорах слово «падруха» или «падрух» могло иметь два значения. Первое — диалектное название для подруги, товарки, но в мужском варианте это звучит маловероятно. Второе, более правдоподобное — искажённая форма от «падчерица» или «пасынок»? Нет, тут другая логика.

Вероятнее всего, перед нами вариант имени Падруха, которое восходит к греческому Патрокл (через народную переделку). Или же это прозвище от слова «падера» — так в некоторых областях называли бурю, непогоду, сильный ветер. Тогда Падруха — человек, получивший такое прозвище за буйный нрав или, наоборот, родившийся в ненастье. Ономасты (в частности, Б. Унбегаун) отмечают, что фамилии на -ухин, -юхин часто возникали от прозвищ с суффиксом -уха, который придавал имени фамильярный или уменьшительный оттенок.

Фамилия редкая. Её географическое бытование, судя по доступным данным, тяготеет к центральным и поволжским областям России, где были распространены подобные диалектные формы. Социальный состав носителей — в основном крестьянство и мещанство, так как фамилии на -ин у дворян были редкостью. Таким образом, предок Падрухиных — человек по прозвищу или имени Падруха, живший, скорее всего, в XVI–XVII веках.