Фамилия Пахандрина — редкий случай, где нестандартная основа соединилась с типовой русской моделью. Окончание -а выдает женскую форму, мужской вариант — Пахандрин. В основе лежит прозвище или некалендарное имя, а суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Пахандрин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Пахандра.

Самое сложное — корень. В русских говорах слова «пахандра» нет. Возможны две версии, и обе ведут к диалектам или искажениям. Первая: основа от глагола «пахать» с экспрессивным суффиксом -ндр-, как в словах «кулёма» или «шандра». Такая модель встречается в северных и сибирских говорах, где прозвища часто образовывали от занятий с неожиданными суффиксами. Пахандра мог означать «пахарь», но с оттенком небрежности или просторечия.

Вторая версия — искажение имени или прозвища из другого языка. Например, от греческого «папандреу» (священник) или тюркского «пахан» (владыка, господин). Но это гадательно: без конкретных записей в переписных книгах такая этимология остается гипотезой. Правдоподобнее всего — местное прозвище, возникшее в крестьянской среде центральной России или Поволжья. Суффикс -ин и окончание -а (вместо -ов) типичны для фамилий, образованных от прозвищ на -а: Пахандра → Пахандрин.

Фамилия крайне редкая. В дореволюционных справочниках и советских телефонных книгах она почти не встречается. Это говорит о том, что род мог быть малочисленным или проживать в изолированной местности. По данным современных баз, Пахандрины встречаются в Пермском крае и на Урале — регионах, куда в XVII–XVIII веках ссылали крестьян и где оседали носители редких прозвищ. Социально предки, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, а фамилия закрепилась уже после отмены крепостного права, когда бывшим крепостным массово давали фамилии по прозвищам.