Фамилия Пактусова — женская форма, а её мужской вариант Пактусов — редкая русская фамилия, которая почти наверняка имеет искусственное, семинарское происхождение. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, образованных от мирских имён, прозвищ или профессий, Пактусов построена от латинского слова pactus — «мирный договор», «соглашение» или «союз». В латыни это причастие от глагола paciscor (договариваться), и именно его брали за основу при составлении фамилий для воспитанников духовных семинарий в XVIII–XIX веках.

Семинарские фамилии часто были «говорящими» и давались по успехам ученика, по его характеру или просто как благозвучный латинизированный вариант. Пактусов мог получить ученик, отличавшийся миролюбивым нравом, дипломатичностью, или же тот, кто хорошо разбирался в церковном праве и канонах, связанных с договорами. Такие фамилии не имели корней в крестьянском или купеческом быту, они целиком принадлежали церковной среде, поэтому носители Пактусовых — почти поголовно потомки духовенства: священников, дьяконов, псаломщиков.

В словообразовательном плане фамилия проста: основа pactus + типичный русский суффикс принадлежности -ов. Для женской формы добавляется окончание -а. Это стандартная модель для фамилий, которые в мужском роде склоняются как прилагательные (Пактусов, Пактусова). Никаких диалектных или региональных особенностей у неё нет, потому что семинарские фамилии распространялись по всей империи вместе с выпускниками, которых отправляли служить в разные епархии.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает версию. В той же среде появились Пактовы, Пактовские (от того же pactus), а также фамилии вроде Аманатов (от лат. amatus — любимый), Фортунатов (от fortunatus — счастливый). Все они — «кабинетные» конструкции, придуманные наставниками. Фамилия Пактусова не имеет отношения к географическим названиям или профессиям — это чистый след образовательной политики Русской православной церкви, когда будущим священникам давали фамилии, звучавшие по-европейски учёно.