Фамилия Пактусов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с характером или внешностью, а с конкретным предметом обихода — и, возможно, с не самой почётной профессией. В её основе лежит слово «пактус» — так в некоторых русских говорах, особенно на северо-западе и в приграничных с Прибалтикой районах, называли паклю, то есть грубое волокно для конопачения щелей в срубах. Сам термин, скорее всего, заимствован из немецкого (Packtuch — грубая упаковочная ткань) или через посредничество польского языка.

Если исходить из этой версии, то Пактусов — это отчество от прозвища Пактус, которое могли дать человеку, имевшему дело с этим материалом: пакольщику, конопатчику, торговцу паклей или просто неряшливому, «лохматому» человеку, которого в насмешку сравнивали с паклей. Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей сын?» — «Пактусов»), то есть буквально «сын Пактуса». Фамилия фиксируется преимущественно в Псковской и Новгородской областях, что подтверждает её северо-западную географическую привязку.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с календарным именем Пакт — редкой формой крестильного имени Ипатий (в просторечии Ипат). В этом случае Пактус — это уменьшительно-пренебрежительная форма, а Пактусов — «сын Пактуса», то есть потомок Ипатия. Однако эта гипотеза слабее: имя Ипатий не было широко распространено, а связь с паклей и ремеслом выглядит и семантически, и географически убедительнее.

Обратите внимание на редкость самой фамилии: она не вошла в массовые справочники и не имеет известных дворянских или купеческих ветвей. Носители Пактусовых — это, скорее всего, потомки крестьян или ремесленников из северо-западных губерний Российской империи, чьи предки получили прозвище по роду занятий. В дореволюционных метрических книгах фамилия встречается эпизодически, что говорит о её локальном, а не общерусском бытовании.