Фамилия Пахтусов образована от прозвища Пахтус. Даля встречается глагол «пахтать» — «взбалтывать, взбивать что-либо, встряхивая сосуд» и однокоренное слово «пахтус» — «ком масла, взбитого в один прием и идущего вторично в перетопку». Поэтому можно предположить, что основатель рода Пахтусовых занимался изготовлением масла. Однако не исключено, что прозвище связано с этим же глаголом, но уже в переносном значении «нянчиться, пестоваться, возиться, хлопотать». В таком случае Пахтусом могли прозвать хозяйственного человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пахтус, со временем получил фамилию Пахтусов.