Фамилия Пангратян — армянская по происхождению, и её разумнее всего рассматривать в контексте армянской антропонимии, а не русской. Формальный показатель здесь — суффикс -ян (в дореволюционной орфографии часто писалось как -янц), который в армянском языке выполняет ту же роль, что русские -ов/-ев или -ин: указывает на принадлежность, происхождение, родство. Буквально Пангратян значит «из рода Панграта» или «потомок Панграта».

Основа фамилии — личное имя Панграт. Это армянская форма греческого имени Панкратий (Πανκράτιος), которое состоит из двух корней: πᾶν (pan) — «всё, весь» и κράτος (kratos) — «сила, власть». Таким образом, Панкратий означает «всесильный», «всемогущий». Имя было распространено в христианском мире благодаря святому Панкратию, раннехристианскому мученику. В армянской традиции оно адаптировалось как Панграт, а затем и фамилия Пангратян.

Интересно, что в русском языке существует схожая фамилия Панкратов — того же корня, но образованная по русской модели от канонического имени Панкратий. Пангратян же — это именно армянский вариант, где греческое имя прошло через живую народную речь. Если предки носителя фамилии жили в Российской империи, в метрических книгах или ревизских сказках фамилию могли записать и как Пангратов или Панкратьянц — в зависимости от того, как чиновник на слух передавал армянское произношение.

Географически фамилия Пангратян встречается среди армян, рассеянных в результате геноцида начала XX века, а также в среде армянской диаспоры в России, Грузии, Армении и странах Ближнего Востока. Конкретного «гнезда» в пределах одной области нет — это не топонимическая фамилия, а патронимическая, то есть образованная от имени предка. Сословных ограничений у таких фамилий не было: Пангратянами могли быть и крестьяне, и ремесленники, и священники.

В написании возможна вариативность: в западных диаспорах (французская, американская) фамилию могли передавать как Pangratian или Pangratyan. В русской традиции ударение обычно падает на последний слог — Пангратя́н, что соответствует армянской норме произношения.