По одной из них, она образована от прозвища Паничка, которое восходит к нарицательному «пан». Возможно также, что прозвище Паничка имело ироническое значение. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, в основе фамилии лежит имя Паничка – уменьшительная форма имен Павел (от латинского «маленький»), Панфил (от греческого «общий друг»), Панкратий (греч. Скорее всего, основатель рода Паничкиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Паничка, со временем получил фамилию Паничкина.