По одной из них, она образована от прозвища Паничка, которое восходит к нарицательному «пан». Возможно также, что прозвище Паничка имело ироническое значение. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, в основе фамилии лежит имя Паничка – уменьшительная форма имен Павел (от латинского «маленький»), Панфил (от греческого «общий друг»), Панкратий (греч. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Паничка, со временем получил фамилию Паничкин.