Фамилия Пантополь звучит нехарактерно для восточнославянского уха — и это ключ к её происхождению. В ней нет типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, да и корень «пант-» с окончанием «-поль» выбивается из привычного ряда. Скорее всего, перед нами фамилия греческого или южнославянского (возможно, молдавского) корня, причём образованная по модели, характерной для фамилий священников или выпускников духовных семинарий.

Разберём состав. Первая часть — «Пант-» — восходит к греческому παντ- (panт-), что значит «всё», «весь». Это частый элемент в греческих именах и прозвищах (Пантелеймон, Пантократор). Вторая часть — «-поль» — от греческого πόλις (полис), «город». Вместе «Пантополь» дословно означает «всегород» или «всемирный город». Такие сложносоставные фамилии на -поль (Константинополь, Севастополь) в русской среде обычно давали не по месту жительства, а как «кабинетные» фамилии в духовных училищах. Семинаристу, который блистал познаниями или происходил из многолюдного места, могли присвоить звучную фамилию Пантополь — намёк на широту или столичный размах.

Вторая, более прозаичная версия — фамилия могла возникнуть у греков или молдаван, переселившихся в Россию. В греческой ономастике встречаются фамилии на -пулос (сын), но форма «Пантополь» могла адаптироваться под славянское произношение. Также не исключено, что это топонимическая фамилия: в Греции или на Балканах существовал населённый пункт с похожим названием, а его выходец стал Пантополем.

Географически фамилия редкая и тяготеет к югу России и Украины, особенно к территориям бывшей Новороссии и Бессарабии, где было много греческих и молдавских колоний. Сословно носители Пантополь в XIX веке чаще всего оказывались либо в среде духовенства, либо среди мещан и купцов греческого происхождения.

Сравните с однокоренными фамилиями: Пантелеев (от имени), Пантюхов (от прозвища), Полтавский (от города). Пантополь стоит особняком — это не патроним и не прозвище по ремеслу, а искусственное, книжное образование. Если ваш предок носил эту фамилию, с большой вероятностью он был либо выпускником семинарии, получившим «говорящую» фамилию, либо выходцем из греческой диаспоры.