Фамилия Паньтюшкова — редкий случай, когда основа угадывается не сразу, а суффикс подсказывает ответ. В ней нет типичного для русских фамилий суффикса -ов/-ев, который присоединяется к прозвищу или профессии. Здесь работает модель на -ин, а значит, в основе лежит имя или прозвище, оканчивающееся на -а/-я. Исходная форма — Паньтюшков, а женский вариант Паньтюшкова — это просто форма родительного падежа («жена Паньтюшкова»), закрепившаяся в документах.

Корень фамилии — Паньтюшк-. Это уменьшительно-ласкательная форма от имени Пантелей, Пантелеймон или Панфил. В народной речи имя Пантелеймон (греч. «всемилостивый») сокращали до Паня, Пантя, Пантюша. Добавление суффикса -юшк- (как в Ванюшка, Петюшка) давало Пантюшка — «маленький Пантелей». Затем, по обычной логике, прозвище Пантюшка перешло в фамилию Пантюшков, а с чередованием гласной (а → я) или под влиянием местного говора — в Паньтюшков. Второй вариант менее частотен, но встречается в северных и вятских говорах, где «я» заменяло «а» в безударных слогах.

Географически фамилия привязана к русскому Северу и Вятке. В переписях XVIII–XIX веков Паньтюшковы фиксировались в Вологодской, Вятской и Пермской губерниях. Это крестьянская фамилия: предки, скорее всего, были государственными или монастырскими крестьянами, носившими имя Пантелей в честь святого, почитаемого на Руси как целителя. Дворянских родов с такой фамилией нет, и в списках служилых людей она не значится.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает увидеть разницу. Пантелеев — от полной формы имени, Пантюков — от той же основы, но с другим суффиксом, Паньков — от краткой формы Панька. Паньтюшков стоит особняком: его суффикс указывает на прозвище, а не на отчество от канонического имени. Это не «сын Пантелея», а «сын Пантюшки» — так в быту называли человека, чтобы отличить его от других Пантелеевых в деревне.