Имя Пантелеймон в переводе с греческого означает «всемилостивый». В основу же данной фамилии легла его уменьшительно-ласкательная форма - Пантюшка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пантюшка, со временем получил фамилию Пантюшкин.