Фамилия Панутрева — женская форма, мужской вариант — Панутрев. Это редкая фамилия, которая почти наверняка имеет искусственное, семинарское происхождение. В русской ономастике фамилии с суффиксом -ев чаще всего образуются от мирских имён, прозвищ или профессиональных названий (кузнец → Кузнецов), но с основой «панутр-» история иная.

Скорее всего, в основе лежит латинское слово «panis» — хлеб, и «uter» — утроба, чрево. Вместе они дают «хлебное чрево» или «утроба хлеба». Это типичный приём для фамилий, которые давали выпускникам духовных семинарий в XVIII–XIX веках. Семинаристам, не имевшим наследственной фамилии, часто присваивали «говорящие» фамилии на латыни или греческом, связанные с христианскими добродетелями, церковными понятиями или просто благозвучные. «Панутрев» мог означать «сытый», «благодатный», «кормящий» — своего рода метафора духовной или телесной полноты.

Вторая, менее вероятная версия — искажённая запись фамилии от диалектного прозвища. В некоторых говорах «панутра» могло означать нечто внутреннее, нутряное (от «утроба»), а приставка «па-» указывала на сходство или отношение. Но тогда фамилия звучала бы как «Панутров», а не «Панутрев». Окончание -ев указывает на книжное, а не народное происхождение: в русских говорах прозвища на -утра давали бы фамилии с суффиксом -ин (Панутрин), а тут — явная калька с латинского корня.

Географически носители фамилии Панутрева встречаются в основном на юге России и в Поволжье — в регионах, где было много духовных училищ и семинарий. Сословно предки, скорее всего, принадлежали к духовенству: либо к священникам, либо к причетникам (дьячкам, пономарям). Дворянских корней у этой фамилии нет — искусственные семинарские фамилии редко получали дворяне.

Отличительная черта фамилии — её абсолютная прозрачность для этимолога, знающего латынь, и полная загадочность для носителя русского языка. Она не связана ни с ремеслом, ни с местностью, ни с именем предка — это чистая интеллектуальная конструкция, придуманная за письменным столом в стенах семинарии.