Фамилия Папагианиди происходит от прозвища Папагианис, которое восходит к двум греческим основам: «папа» и «гианис». «Папа» переводится на русский язык как «священник». Вторая основа «гианис» является мужским греческим именем Гианис или Иоанн. В целом, прозвище Папагианис переводится как «священник по имени Гианис». Одним из святых покровителей имени Гианис или Иоанн является апостол Иоанн Богослов. Согласно преданию, он непрестанно проповедовал язычникам о Христе.