Фамилия Патрогин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного прозвищного корня вроде «патрон» или «патруль», хотя на слух такая связь напрашивается. Чтобы разобраться, откуда она взялась, нужно смотреть не на современное звучание, а на то, как и где её могли образовать.

Суффикс -ин указывает на притяжательную модель: «чей?» — Патрогин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Патрога. Это классическая севернорусская и сибирская модель образования фамилий от усечённых форм имён. Основа «Патрог-» скорее всего восходит к крестильному имени Патрокл (греч. «слава отца»). В русской народной традиции длинные греческие имена часто сокращали: Патрокл превращался в Патру, Патрошу, а в диалектах — и в Патрогу. В олонецких и архангельских говорах такое стяжение встречалось нередко: например, от Евстрат получали Страт, от Патрокл — Патрог.

Есть и вторая, менее вероятная версия. В некоторых говорах «патрога» могло быть прозвищем человека, который «патроет» — то есть медлит, копается или, наоборот, что-то чинит, «патрует» (от диалектного глагола «патроить» — возиться, ладить). Но эта гипотеза слабая: глагол редкий, и его прозвищное употребление не зафиксировано в ономастических источниках. Основной путь — через имя Патрокл.

Фамилия Патрогин почти не встречается в центральных и южных регионах России. Основные носители — на Русском Севере, в частности в бывшей Вологодской губернии, а также среди старообрядцев Забайкалья, куда фамилия могла попасть с переселенцами. Социальный состав предков — скорее всего крестьяне или посадские люди, поскольку фамилии на -ин у непривилегированных сословий в тех краях были нормой.

Сегодня Патрогины — редкость, и каждый носитель этой фамилии хранит связь с древним греческим именем, которое в русской глубинке обрело собственную, ни на что не похожую форму.