Фамилия Пайдутов — одна из тех, где на первый взгляд слышится что-то нерусское, но при ближайшем рассмотрении она оказывается вполне местной, хотя и редкой. Её основа — прозвище Пайду́т, которое в русских говорах могло означать «неповоротливый, неуклюжий человек» или, в ином значении, «тот, кто ходит вразвалку». Глагол «пайдать» (или «пайдить») в диалектах северо-запада и центра России фиксируется со значением «падать, валиться», отсюда и прозвище для того, кто часто спотыкается или ходит тяжело. Прямых параллелей в тюркских или финно-угорских языках, которые могли бы дать похожую основу, нет, хотя фамилия и звучит на тюркский лад — скорее всего, это случайное созвучие.

Словообразовательная модель проста: к основе Пайдут- добавляется типичный русский суффикс принадлежности -ов, образующий фамилии от прозвищ и имён (ср. Иванов, Петров). Ударение, судя по произносительной норме, падает на второй слог: Пайду́тов. Важно, что фамилия не имеет суффикса -ин, который указывал бы на происхождение от женского имени или прозвища, — перед нами именно патроним от мужского прозвища.

Географически фамилия привязана к регионам, где бытовало слово «пайдать». Наибольшая концентрация носителей — в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, а также в соседних районах Удмуртии и Татарстана. Это зона севернорусских говоров, и именно там прозвище Пайдут могло закрепиться за человеком, который «пайдает» — падает, оступается. Однако есть и альтернативная версия: в некоторых местностях «пайдутом» называли неловкого, но добродушного увальня, и прозвище не несло резко отрицательного оттенка, а скорее было бытовой характеристикой.

Социальный статус предков Пайдутовых, скорее всего, был крестьянским. Фамилия не встречается в дворянских родословных книгах, не образует гнезда с однокоренными фамилиями (например, Пайдутов — единственная форма, вариантов вроде Пайдутский или Пайдутовский нет). Это указывает на то, что фамилия возникла в среде, где прозвища давали по внешним признакам или поведению, и закрепилась в документах в поздний период — вероятно, в XVIII–XIX веках, когда крестьянам стали массово присваивать фамилии.

Из-за редкости фамилии (в современных базах данных — не более нескольких сотен носителей) её этимология остаётся малоизученной, но диалектная версия с «пайдать» выглядит наиболее состоятельной. Если бы основа была тюркской (например, от «бай» — богатый или «тут» — остановка), мы бы ждали окончания -ов, но в таком случае фамилия звучала бы как Байдутов, а не Пайдутов. Так что Пайдутов — это, скорее всего, прозвище русского крестьянина, которое со временем стало фамилией.