Фамилия Пегачкова — женская форма фамилии Пегачков, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или диалектным словом. Основа здесь — «пегач», которое в русских говорах могло означать пегого, то есть пёстрого, пятнистого человека или животное. Слово «пегий» (рябой, с белыми пятнами на тёмном фоне) широко употреблялось в северных и сибирских говорах; от него образовали множество прозвищ — Пегач, Пегаш, Пеган. Прозвище Пегач давали либо человеку с неровным цветом кожи (веснушки, родимые пятна), либо тому, кто держал пегую лошадь или сам отличался пёстрой одеждой.

Суффикс «-ов» в основе Пегачков указывает на типичную русскую модель «чей?»: Пегачков буквально значит «сын Пегача». Удвоение суффикса («-чк-» перед «-ов») — редкая деталь. Она могла возникнуть из-за того, что исходное прозвище звучало как Пегачок (уменьшительно-ласкательная форма), а уже от него образовали фамилию Пегачков. Либо это результат народной переработки: носители фамилии на слух добавляли уменьшительный суффикс, чтобы отличить её от более распространённой фамилии Пегачев.

В ономастических справочниках фамилия Пегачков не относится к массовым. Она встречается эпизодически в центральных и южнорусских областях, а также на Урале, куда переселенцы принесли северные говоры. Вероятно, предки носителя фамилии были крестьянами или посадскими людьми: прозвища по внешним признакам в этой среде давали особенно часто, и они легко закреплялись в качестве родового имени.

Интересно, что фамилия Пегачкова — относительно молодая по форме: в документах XVII–XVIII веков чаще встречаются Пегачев или Пеганов. Вариант с «-чк-» мог закрепиться только к XIX веку, когда фамилии окончательно стандартизировались. Если искать однокоренные параллели, стоит вспомнить фамилии Пеганов, Пегашев, Пегачёв — все они восходят к тому же корню «пег-», но с разными суффиксами, что показывает, насколько вариативным было народное словообразование.