В основе фамилии лежит имя Пенкрат — вариант имени Понкрат. Чередование гласных о/е стало результатом «екающего» говора. Понкрат является краткой формой мужского имени Панкратий. Это имя образовано от древнегреческого «pankratos», что в переводе на русский язык означает «сильнее всех».