Фамилия Пердунець звучит необычно и сразу привлекает внимание своей физиологичностью. Вопреки возможным догадкам, её основа не связана с грубым просторечием напрямую, а восходит к древнему славянскому глаголу «пердѣти» — то есть «громко выпускать газы». В старину это слово не имело такого резко негативного оттенка, как сегодня, и могло использоваться как прозвище для человека с характерным недугом или просто забавной особенностью организма. Такие прозвища давали не со зла, а скорее для меткой характеристики — по меткому замечанию этнографов, в крестьянской среде телесные проявления не считались чем-то постыдным и нередко становились основой для уличных имён.

Словообразовательная модель фамилии указывает на её западноукраинское или польское происхождение. Суффикс -ець (в украинской передаче -ець, в польском -ec) характерен для фамилий, образованных от прозвищ или глагольных основ: он придаёт значение «носитель признака» или «тот, кто совершает действие». Таким образом, Пердунець — это «тот, кто пердит», то есть человек, получивший такое прозвище за соответствующее поведение. В польском языке существует аналогичная фамилия Perduniec, что подтверждает её западнославянские корни. Украинский вариант с мягким знаком на конце — Пердунець — типичен для Галичины, Волыни или Подолья.

В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые часто фиксировали принадлежность к отцу (сын Пердуна), форма на -ець закрепила само прозвище как родовое имя. Это указывает на то, что фамилия могла возникнуть не в среде московского служилого люда, а среди казачества или крестьянства Речи Посполитой. В документах XVIII–XIX веков такие прозвища встречаются среди реестров казаков и мещан, где фиксировали не только благозвучные, но и самые бытовые характеристики человека.

Встречается фамилия и сегодня — преимущественно на западе Украины, в Тернопольской, Львовской и Ивано-Франковской областях. В России и Беларуси она редка, но не исчезла полностью. Носителям фамилии не стоит смущаться её звучания: в историческом контексте это всего лишь меткое народное прозвище, каких тысячи — Громыхало, Сопляк, Зубодер. Со временем грубость стёрлась, осталась лишь фамильная память о предке, которого в деревне знали по его яркой особенности.