Фамилия Пидеры — редкий случай, когда внешняя форма почти кричит об иноязычном происхождении, но на деле всё может оказаться сложнее и прозаичнее. В русской ономастике фамилии на -ы, -их (Пидеры, Косых, Черных) характерны для северных и центральных областей России, а также для Сибири, где они фиксировали принадлежность к роду или дому: «из дома Пидеров» или «Пидеры дети». Однако основа «Пидер-» для исконно русского прозвища или имени нетипична.

Скорее всего, фамилия имеет немецкие корни. В немецком языке существует фамилия Pider (от средневерхненемецкого biderbe — «честный», «дельный»), которая могла попасть в Россию вместе с колонистами в XVIII–XIX веках. В документах переселенцев встречаются варианты Пидер, Пидерс, Пидерман. При адаптации к русской грамматике фамилия получила типичное окончание множественного числа -ы, указывающее на целый род: Пидеры — «семья Пидеров». Это же окончание могло закрепиться в письменных записях сельских сходов или церковных метрик, где целую семью записывали как «Пидеры».

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от личного имени или прозвища, образованного от диалектного глагола «пидерить» (в некоторых говорах — «медлить», «копаться») или от названия растения (сравните с «пидер» — вид осоки в псковских говорах). Но такие гипотезы не подкреплены словарями русских фамилий — ни у Унбегауна, ни у Никонова эта фамилия не разбирается, что косвенно подтверждает её неисконный характер.

Географически фамилия Пидеры встречается в единичных записях в Поволжье (бывшие немецкие колонии) и на Урале. Носители могли быть потомками немецких ремесленников или крестьян, осевших в России. Сословная принадлежность не фиксируется, но, учитывая историю немецких колонистов, предки скорее всего были крестьянами или мещанами.

Словообразовательная модель проста: корень Пидер- + окончание -ы. Ударение, вероятно, падает на первый слог: Пи́деры. В современном русском языке фамилия звучит архаично и сразу выделяется на фоне типичных -ов/-ев, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска именно по немецким корням.