Фамилия Пимерзин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычного суффикса -ов/-ев или -ин, что сразу наводит на мысль: основа уходит корнями не в русское, а в тюркское или арабское имя. По всей видимости, в основе лежит имя Пимерс, которое могло быть вариантом имени Бимерс (от арабского «бимарис» — «больной», «страждущий»). В тюркской среде такие имена иногда давали как оберег: считалось, что имя с «плохим» значением отпугнёт злых духов от ребёнка.

Суффикс -ин в фамилии — классический русский патронимический показатель, указывающий на принадлежность: «чей?» — Пимерзин, то есть «сын Пимерза» или «потомок Пимерса». Модель образования здесь та же, что у фамилий Кузьмин, Ильин, но основа неканоническая, нецерковная. Это говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, был крещёным татарином, башкиром или представителем другого тюркского народа, у которого личное имя Пимерс со временем русифицировалось.

Географически фамилия встречается в основном в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Это подтверждает её тюркские корни. В дореволюционных метрических книгах она почти не фиксируется, что указывает на позднее оформление — скорее всего, в XIX — начале XX века, когда крестьяне и мещане из национальных окраин получали паспорта и фамилии по отцу.

Сословно предки Пимерзиных были, вероятнее всего, государственными или ясачными крестьянами, реже — мещанами. Дворянских родов с такой фамилией не известно. Если искать однокоренные варианты, то это Пимерсов, Пимерсовский, а также упрощённые формы Пимзин, Пимриков — все они восходят к тому же личному имени, но с разной степенью русификации.

Таким образом, фамилия Пимерзин — это тюркский след в русской антропонимии, имя-оберег, которое через отчество закрепилось за потомками человека по имени Пимерс.