Фамилия Пиндеев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного суффикса -ов-/-ев- в полном виде, но на деле это типичная патронимическая модель: основа Пиндей + суффикс -ев. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Пинде́ев.

Главная трудность — в основе «Пиндей». В русских говорах слово «пиндей» не фиксируется как самостоятельное, поэтому корень, вероятно, иноязычный. Наиболее правдоподобная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках есть корень «пин» или «бин» (тысяча), а также именные формы вроде «Пиндей» — возможно, это адаптация имени Биндей или Миндей, которые встречаются у татар и башкир. В таком случае фамилия Пиндеев означает «сын Пиндея», а само прозвище могло указывать на принадлежность к роду воина или сборщика дани («тысячник»).

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «пиндить» (упрямиться, капризничать, а в некоторых говорах — медлить). Если так, то Пиндей — прозвище медлительного или упрямого человека. Однако эта гипотеза слабее: глагол редкий, и основа «Пиндей» не образуется от него напрямую.

Однокоренных фамилий почти нет. Встречается вариант Пиндеев — с двойным «е» на конце, но это орфографическая случайность. Единичные носители фамилии зафиксированы в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает тюркскую версию: именно в этих регионах активно смешивались русские и тюркские антропонимы.

Сословно фамилия не маркирована: Пиндеевы могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми, получившими прозвище от татарского имени. Точных данных о дворянских родах с этой фамилией нет.