Фамилия Пинджоян — яркий пример армянской модели образования фамилий через суффикс -ян, который восходит к древнему -янц и означает «принадлежащий роду» или «потомок». Основа Пинджо- в русской передаче скрывает армянское слово «пиндж» (փինջ), которое имеет два основных значения: «кисть» (руки) и, в переносном смысле, «гроздь» (винограда). Таким образом, фамилия могла изначально указывать на род занятий — сборщика винограда, виноградаря, или на характерную внешность предка — человека с крупными, сильными кистями рук.

В армянской ономастике суффикс -ян является самым распространённым, вытеснившим более древние формы на -енц и -унц. Фамилии на -ян массово закреплялись в XIX веке, когда армянское дворянство и духовенство, а затем и простые крестьяне, переходили к фиксированным наследственным именованиям. Пинджоян — типичная фамилия западных областей исторической Армении (Западная Армения, ныне территория Турции), где говор на диалекте сохранил форму «пиндж» без перехода в «пинч», характерного для восточных диалектов.

Стоит отметить, что в армянском языке слово «пиндж» имеет ещё одно редкое, диалектное значение — «небольшой мешочек, кисет». В этом случае прозвище Пинджо мог получить мастер, изготавливающий кисеты, или торговец, носивший товар в мешочках. Однако версия с «виноградной гроздью» или «кистью руки» встречается в источниках чаще, так как виноградарство было одним из основных занятий в долинах Западной Армении.

Сравнение с другими армянскими фамилиями на ту же основу — Пинджян, Пинджоян — показывает, что вариант с -о- (Пинджоян) мог возникнуть из формы Пинджо, где -о- является либо диалектным наращением, либо указанием на конкретное лицо (Пинджо — «кистистый»). В русском языке фамилия закрепилась в написании через «о», хотя в армянском оригинале ударение падает на последний слог: Пинджоян.

Социальный состав носителей фамилии, скорее всего, был крестьянским или ремесленным. Армянские фамилии на -ян редко указывают на дворянское происхождение, если только не имеют княжеского суффикса -уни. Пинджоян — фамилия, которая прямо говорит о бытовом прозвище предка, что характерно для подавляющего большинства армянских родовых имён.