Фамилия Пиндюкин — редкий случай, где основа ясна, а происхождение вызывает споры. В центре внимания корень «пинд-», который в русских говорах имеет два совершенно разных значения. Первое — диалектное слово «пиндюк» (или «пиндук») так в некоторых южных и западных регионах называли индюка, искажая звучание. Второе значение грубее: в ряде областей «пиндюк» означало толстяка, пузатого человека. Оба варианта могли лечь в основу прозвища, которое затем закрепилось как фамилия.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Пиндюкин — «сын Пиндюка» или «из семьи Пиндюка». Модель образования типична для русских фамилий от прозвищ, оканчивающихся на согласный. Интересно, что фамилия почти не встречается за пределами России — это указывает на её сугубо локальное, крестьянское происхождение, скорее всего, из южнорусских или западнорусских губерний, где слово «пиндюк» было в ходу.

Сравнение с однокоренными фамилиями даёт подсказку. Пиндюрин, Пиндюров, Пиндюков — все они образованы от одного корня, но с разными суффиксами. Если Пиндюков тяготеет к северным говорам (суффикс «-ов»), то Пиндюкин — южный вариант. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные случаи разбираются как типичные прозвищные фамилии от названий животных или внешних признаков.

Версия о связи с украинским или белорусским языком маловероятна: там индюка чаще называют «индик» или «пуля», а «пиндюк» — именно русский диалектизм. Так что предок носителя фамилии Пиндюкин, скорее всего, либо держал индюков и получил прозвище от соседей, либо сам был человеком плотного телосложения, и это слово закрепилось за его родом.